Janssen theo học toán học và vật lý vì ông có tài năng trong lĩnh vực khoa học. Ông giảng dạy tại Lycée Charlemagne vào năm 1853 và tại một trường học kiến trúc trong các năm 1865 - 1871, nhưng tâm trí của ông chủ yếu là dành cho những nhiệm vụ khoa học được giao. Vì thế, vào năm 1857, Janssen đến Peru với việc tìm ra xích đạo từ tính. Trong các năm 1861, 1862 và 1864, ông nghiên cứu nhiễm độc Telluric trong quang phổ Mặt Trời ở Ý và Thụy Sĩ. Vào năm 1867, Janssen thực hiện các thử nghiệm quang học và từ tính ở Azores. Ông đã thành công trong việc quan sát chuyển động của sao Kim trong hai thời điểmː 1874 ở Nhật Bản và 1882 ở Algérie. Ông cũng quan tâm đến một chuỗi xảy ra pha tối ở Trani (1867), Guntur (1868) và Algiers (1870), Siam (1875), đảo Caroline (1883) và Alcosebre (1905). Để có thể quan sát pha tối vào năm 1870, ông đã phải trốn khỏi Paris đang bị bao vây bằng một chiếc khinh khí cầu. Vào năm 1875, Janssen được chỉ định làm giám đốc của một đài thiên văn được thành lập ở Meudon. Vào năm 1876, Janssen có đặt một loạt các bức ảnh liên quan đến Mặt Trời (chúng ở trong bộ sưu tập Atlas de photographies solaires được xuất bản vào năm 1904). Năm 1896, ông cho xuất bản tập đầu tiên của Annales de l'observatoire de Meudon. Ông là chủ tịch của Hội Thiên văn Pháp trong các năm 1895-1897.[1] Ông qua đời vào ngày 23 tháng 12 năm 1907 tại Paris. Ông được chôn cất tại Nghĩa trang Père Lachaise với cái tên "J. Janssen" trên bia mộ.